1. ภาษีเงินได้หัก ณ ที่จ่าย กรณีธนาคารจ่ายดอกเบี้ยเงินฝากให้สหกรณ์ / ดอกเบี้ยเงินฝากระหว่างสหกรณ์ / เมื่อมีการรับเงินค่าสินค้า)    

           สหกรณ์เป็นนิติบุคคลที่จัดตั้งขึ้นตามพระราชบัญญัติสหกรณ์ไม่เข้าลักษณะเป็นบริษัทหรือห้างหุ้นส่วนนิติบุคคล ตามมาตรา 39 แห่งประมวลรัษฎากร จึงไม่มีหน้าที่ต้องเสียภาษีเงินได้ตามประมวลรัษฎากร ประกอบกับมาตรา 69 ทวิ แห่งประมวลรัษฎากรไม่ได้กำหนดให้สหกรณ์ต้องถูกหักภาษีเงินได้ ณ ที่จ่าย
(ที่มา : หนังสือตอบข้อหารือกรมสรรพากร)

2. ภาษีเงินได้หัก ณ ที่จ่าย กรณีสหกรณ์การเกษตรและกลุ่มเกษตรกรรับซื้อพืชผลทางการเกษตร

          -  เดิมสหกรณ์ซึ่งมีฐานะเป็นนิติบุคคลตามพระราชบัญญัติสหกรณ์ เมื่อจ่ายเงินค่าซื้อพืชผลทางการเกษตรให้แก่ชาวไร่ ไม่ต้องหักภาษีเงินได้ ณ ที่จ่าย แต่ปรากฏว่าสหกรณ์การเกษตรได้กระทำตนเป็นพ่อค้าคนกลาง คือรับซื้อพืชผลทางการเกษตรจาก ชาวไร่แล้วนำไปขายต่อให้แก่บริษัทหรือห้างหุ้นส่วนนิติบุคคลซึ่งเป็นผู้ผลิตหรือผู้ส่งออก ซึ่งการนำพืชผลทางการเกษตรไปขายให้แก่บริษัทหรือห้างหุ้นส่วนนิติบุคคลดังกล่าว สหกรณ์การเกษตรไม่ต้องถูกหัก ภาษีเงินได้ ณ ที่จ่าย เพราะสหกรณ์การเกษตรมีฐานะเป็นนิติบุคคลซึ่งจัดตั้งขึ้นตามกฎหมายพิเศษไม่มีหน้าที่ต้องเสียภาษีอากรตามบทบัญญัติแห่งประมวลรัษฎากร

          -  เพื่อเป็นการป้องกันหลีกเลี่ยงการเสียภาษีอากรและเพื่อความเป็นธรรมในการเสียภาษีอธิบดีกรมสรรพากรจึงได้มีคำสั่งกรมสรรพากรที่ ทป. 18/2530 ฯลฯ ลงวันที่ 10 สิงหาคม พ.ศ. 2530 แก้ไขเพิ่มเติมคำสั่งกรมสรรพากร ที่ ทป. 4/2530 ฯลฯ ลงวันที่ 26 กันยายน พ.ศ. 2528 กำหนดให้ นิติบุคคลซึ่งตั้งขึ้นตามกฎหมายพิเศษ เช่น สหกรณ์หรือกลุ่มเกษตรกร ฯลฯ ซึ่งไม่มีหน้าที่ต้องเสียภาษีเงินได้ ให้มีหน้าที่หักภาษีเงินได้ ณ ที่จ่ายเมื่อจ่ายเงินค่าซื้อพืชผลทางการเกษตรจากชาวไร่

          -  ต่อมากรมสรรพากรเห็นว่า การรวมตัวเป็นกลุ่มเกษตรกรเป็นการรวมตัวของผู้ที่มีอาชีพ ในทางเกษตรกรรม โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อช่วยเหลือซึ่งกันและกันในการประกอบอาชีพเกษตรกรรม ตามหลักเกณฑ์และวิธีการที่กำหนดในพระราชกฤษฎีกา ออกตามความในพระราชบัญญัติสหกรณ์ พ.ศ.2511 เนื่องจากยังไม่อาจดำเนินการจัดตั้งเป็นสหกรณ์ตามหลังเกณฑ์ที่มาตรา 118 ทวิ แห่งพระราชบัญญัติฉบับดังกล่าวกำหนดไว้ได้ ประกอบกับการดำเนินการของกลุ่มเกษตรกรนั้นผู้เป็นสมาชิกของกลุ่มสละเวลาเข้ามาทำงานให้กับกลุ่มเกษตรกร โดยมิได้รับค่าตอบแทน การที่กำหนดให้กลุ่มเกษตรกรมีหน้าที่หักภาษีเงินได้ ณ ที่จ่ายจึงอาจเป็นภาระแก่กลุ่มเกษตรกรได้

           -  กรมสรรพากรจึงได้มีคำสั่งกรมสรรพากรที่ ทป. 23/2531 ฯลฯ ลงวันที่ 26 กันยายน พ.ศ. 2531 แก้ไขเพิ่มเติม โดยคำสั่งกรมสรรพากร ที่ ทป. 4/2528 ฯลฯ ลงวันที่ 26 กันยายน พ.ศ. 2528 ซึ่งแก้ไขเพิ่มเติม โดยคำสั่งกรมสรรพากรที่ ทป. 18/2530 ฯลฯ ลงวันที่ 10 สิงหาคม พ.ศ. 2530 กำหนดให้กลุ่มเกษตรกรตามกฎหมายว่าด้วยสหกรณ์ ไม่ต้องหักภาษีเงินได้ ณ ที่จ่าย กรณีรับซื้อพืชผลทางการเกษตรอีกต่อไป

(หนังสือกรมสรรพากร ที่ กค 0802/19478 ลงวันที่ 12 กันยายน 2534)